Idéalement, le bassin de jardin comporte une zone peu profonde (-20 cm à -40 cm), une zone moyennement profonde (-50 cm à -60 cm) et une zone plus profonde à 90 cm. Ainsi chaque espèce végétale ou animale peut trouver son emplacement privilégié.
Le soleil chauffe les couches supérieures de l'eau et crée ainsi un environnement idéal pour les petits animaux aquatiques et les nénuphars.